Может ли банк заблокировать карту из-за множества мелких переводов? Например 1000 раз по 10 р?
Если такие переводы по карте идут друг за другом в короткий промежуток времени, то некоторые банки блокируют уже после третьего платежа. При этом может быть либо блокировка возможности дальнейших таких же переводов на сутки, а может быть и блокировка карты.
Большинство банков заблокирует карту или возможность платить в этой торговой точке после 10-го платежа.
Вам скорее всего позвонят из банка и спросят вы ли это переводите. После этого вы можете продолжить делать переводы. 
Однако, это не избавит вас от дальнейших проблем. Банк воспримет эти операции как нестандартные, и, скорее всего, через несколько дней попросит вас объяснить их экономический смысл. Вам придется много повозиться, чтобы вас не внесли в черный список.
Поэтому лучше делать такие переводы не с карты, а через интернет банк со счета.