Для чего нужен отрицательный депозит?
Это сложный и многофакторный процесс.

К примеру,  ставки Европейского центрального банка (ЕЦБ) уже несколько лет остаются отрицательными.

В результате коммерческие банки в Европе платят ЕЦБ за хранение средств и устанавливают отрицательные процентные ставки по депозитам для собственных клиентов

Но Российские банки по законодательству не могут брать с клиентов плату за размещение денег на депозитах, конечно это негативно влияет на их чистые процентные доходы и возможности генерации прибыли.

Сама по себе отрицательная ставка ЕЦБ это следствие кризиса, ЕЦБ стремится подстегнуть спрос через кредитования по максимально низкой ставке. В итоге ЕЦБ постепенно снижает ставку до отрицательных значений. 

Вот такие пироги.