କିନ୍ତୁ ତାଙ୍କର ଦ୍ୱିତୀୟ କାର୍ଯ୍ୟକାଳ କ୍ଷେତ୍ରୀୟ ଅସ୍ଥିରତାର ସମସ୍ୟା ସହ ଜଡ଼ିତ ଥିଲା, ବିଶେଷ କରି ଦେଶର ଉତ୍ତର-ପୂର୍ବ କ୍ଷେତ୍ରରେ ଆସାମରେ, ଯେଉଁଠି ସ୍ଥାନୀୟ ଗଣହତ୍ୟାରେ ୩, ୦୦୦ ଲୋକ ପ୍ରାଣ ହରାଇଥିଲେ, ଏବଂ ପଞ୍ଜାବରେ, ଯେଉଁଠି ଶିଖ ଉଗ୍ରବାଦୀମାନେ ଅଧିକ ସ୍ୱାୟତ୍ତତା ଏବଂ ଏପରିକି ସ୍ୱାଧୀନତା ପାଇଁ ହିଂସାତ୍ମକ ବିକ୍ଷୋଭ କରିଥିଲେ।
ତାଙ୍କର ଦ୍ୱିତୀୟ କାର୍ଯ୍ୟକାଳ ବିଭିନ୍ନ ସମସ୍ୟାର ସମ୍ମୁଖୀନ ହୋଇଥିଲା, ଯେଉଁଥିରେ ଗଣହତ୍ୟା ଠାରୁ ଆରମ୍ଭ କରି ହିଂସାତ୍ମକ ବିକ୍ଷୋଭ ସାମିଲ ଥିଲା।