ଷୋଡ଼ଶ ଶତାବ୍ଦୀରେ ସ୍ପେନରେ ମାନଚିତ୍ର ପ୍ରସ୍ତୁତକାରକମାନେ ଭୁଲରେ ନାମଗୁଡ଼ିକୁ ଦ୍ୱନ୍ଦ୍ୱରେ ପକାଇଥିଲେ, ତେଣୁ ଶେଷରେ ବନ୍ଦରଟି ସାନ ଜୁଆନ ପାଲଟିଗଲା ଏବଂ ସମଗ୍ର ଦ୍ୱୀପକୁ ମାନଚିତ୍ରରେ ଥରେ ଏକ ସମୃଦ୍ଧ ବନ୍ଦର କୁହାଗଲା।
ଏହି ଦ୍ୱୀପର ନାମ ପ୍ରଥମେ ପ୍ୟାର୍ଟୋ ରିକୋ ରଖାଯାଇଥିଲା, କିନ୍ତୁ ୧୯୬୩ ମସିହାରେ ଏହାର ନାମ ପରିବର୍ତ୍ତନ କରାଯାଇ ସାନ ଜୁଆନ ରଖାଯାଇଥିଲା।