गुफा में सीढ़ियां नीचे की ओर जाती हैं और सेंट फ्रांसिस के मकबरे की ओर जाती हैं, जो पेरूगियन लुटेरों से छिपाई जाने के सदियों बाद 1818 में फिर से खोजी गई थीं।
ऐसा माना जाता था कि सेंट फ्रांसिस का मकबरा वर्षों से खो गया था।