जिस पहाड़ी पर यह खड़ा है और जो मध्य युग में एक मलेरिया दलदल से घिरा हुआ था, उस पर नाम रखा गया, वैटिकन 600 से अधिक वर्षों से पोप का निवास रहा है, लेकिन 1929 में मुसोलिनी द्वारा हस्ताक्षरित लैटरन संधि के बाद से ही इटली से स्वतंत्र एक संप्रभु राज्य रहा है।
20 वीं शताब्दी की शुरुआत में, मुसोलिनी ने लेटरन संधि पर हस्ताक्षर करने से इनकार कर दिया।