पुर्तगालियों ने 1641 में मलेरिया और पेचिश से परेशान होकर आत्मसमर्पण कर दिया और गोवा से अपनी सामान्य सहायता लेने से इनकार कर दिया।
बीमारी और सुदृढ़ीकरण की कमी ने 1641 में पुर्तगालियों की हार में योगदान दिया।