हालांकि, लागत मॉडल की सटीकता में तब तक महत्वपूर्ण सीमाएं होती हैं जब तक सिस्टम के आकार और लागत ड्राइवरों की अंतर्निहित धारणाओं को सावधानीपूर्वक नहीं चुना जाता है और सिस्टम विकास में एजेंसी के पिछले अनुभव को प्रतिबिंबित नहीं करता है।
लागत मॉडल की सटीकता में प्रमुख सीमाएं हैं।