पश्चिमी व्यापार का केंद्र बनने के अलावा, नागासाकी ने आज टोकुगावा शोगनों के क्रूर दमन के २५० साल बाद कैथोलिक चर्च के लिए जापान में एक दृढ़ आधार प्रदान किया।
नागासाकी ने दोनों पश्चिमी व्यापार के केंद्र के रूप में कार्य किया-कैथोलिक चर्च के लिए एक क़दम।