तीसरा कमरा मिस्र के इतिहास के तथाकथित विधर्मी काल के लिए समर्पित है, जब अहकेनातेन ने केवल एक भगवान के आधार पर एक धर्म की स्थापना की और मध्य मिस्र में टेल अल अमरना में एक राजधानी की स्थापना की।
तीसरे कमरे में अहकेनातेन के शासन के दौरान बनाए गए टुकड़े हैं।