పాశ్చాత్య వాణిజ్యానికి కేంద్రంగా మారడంతో పాటు, టోకుగావా షోగన్ల ఆధ్వర్యంలో 250 సంవత్సరాల క్రూరమైన అణచివేత తర్వాత నాగసాకి నేడు క్యాథలిక్ చర్చికి జపాన్లో స్థిరమైన స్థానాన్ని సంపాదించుకుంది.
నాగసాకి పాశ్చాత్య వాణిజ్యానికి కేంద్రంగా పనిచేసింది-కాథలిక్ చర్చి పాదం మోపింది.