టోకుగావా షోగన్లు క్రైస్తవత్వాన్ని నిషేధించి పౌరులను బౌద్ధులుగా నమోదు చేయమని ఆదేశించిన తరువాత చైనా (1620) నిర్మించిన జెన్ బౌద్ధ దేవాలయాలలో కోఫుకుజి ఆలయం మొదటిది.
కోఫుకుజి ఆలయాన్ని 1500 వ శతాబ్దం చివరిలో చైనీయులు నిర్మించారు.