12 వ శతాబ్దం నుండి జెన్ జపాన్లో ఉన్నప్పటికీ, దాని ఆధిపత్యం కామాకురా పాలనలో ప్రారంభమైంది, ఇది రహస్యమైన చైనీస్ తత్వశాస్త్రాన్ని జపనీస్ సున్నితత్వం, ప్రభావవాదం, రూపం, ఆచారాల పట్ల ప్రేమకు అనుకూలంగా కనుగొంది.
జెన్ జపాన్లో ప్రారంభంలో ఉన్నప్పటికీ, దానిని ఆచరించేవారిని నాశనం చేయడానికి ప్రయత్నిస్తున్న బౌద్ధులు వెంటనే దాన్ని నిర్మూలించారు.