ആദ്യത്തെ യൂറോപ്യന്മാരുടെ വരവിനു വളരെ മുമ്പുതന്നെ, ചൈനയുമായുള്ള ജപ്പാന്റെ വ്യാപാരത്തിന്റെ പ്രധാന കേന്ദ്രമായിരുന്നു നാഗസാക്കി.
യൂറോപ്യന്മാർ വന്നശേഷം, ചൈനയുമായുള്ള ജപ്പാന്റെ വ്യാപാരത്തിൽ നാഗസാക്കി ഒരു പ്രധാന പങ്ക് വഹിച്ചില്ല.