എന്നിരുന്നാലും, ഒരു പ്രത്യേക ഓപ്പറേറ്റിംഗ് സിസ്റ്റത്തിനായി എഴുതിയതിനേക്കാൾ ജാവ പ്രോഗ്രാമുകൾ ഇപ്പോഴും വളരെ മന്ദഗതിയിലാണ്, ഉഭയചര ജീവികൾ കരയിൽ സസ്തനികളെപ്പോലെ നല്ലതല്ല അല്ലെങ്കിൽ മത്സ്യം പോലെ വെള്ളത്തിൽ നല്ലതല്ല.
വിൻഡോസിനായി എഴുതപ്പെട്ട പ്രോഗ്രാമുകളേക്കാൾ വേഗത്തിലാണ് ജാവ പ്രോഗ്രാമുകൾ പ്രവർത്തിക്കുന്നത്.