മെഡിക്കൽ കൈഡിന്റെ മൊത്തത്തിലുള്ള മാനേജ്മെന്റിന്റെ ഉത്തരവാദിത്തം സി. എം. എസിനാണ്, എന്നിരുന്നാലും, ഓരോ സംസ്ഥാനവും സ്വന്തം പ്രോഗ്രാം കൈകാര്യം ചെയ്യുന്നതിനുള്ള ഉത്തരവാദിത്തമുണ്ട്.
മെഡിക്കെയ്ഡിന്റെ മാനേജ്മെന്റിന്റെ എല്ലാ വശങ്ങൾക്കും സിഎംഎസ് ഉത്തരവാദിത്തമാണ്, വ്യക്തിഗത സംസ്ഥാനങ്ങൾക്ക് മാനേജ്മെന്റിന്റെ ഉത്തരവാദിത്തമില്ല.