വളരെ ഓട്ടോമേറ്റഡ് പരിതസ്ഥിതിയുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ചില സവിശേഷമായ അപകടസാധ്യതകൾ കാരണം, ഒരു വ്യക്തിയെ സ്ഥിരീകരിക്കാൻ ഉപയോഗിക്കുന്ന പാസ്വേഡ്, ഉപയോക്തൃ തിരിച്ചറിയൽ അധിഷ്ഠിത സിസ്റ്റങ്ങൾ എന്നിവ പേപ്പർ അധിഷ്ഠിത സിസ്റ്റങ്ങൾ നൽകുന്ന അതേ അളവിലുള്ള ഉറപ്പ് നൽകുന്നില്ല.
പേപ്പർ അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള സിസ്റ്റങ്ങൾ പോലെ ഓട്ടോമേറ്റഡ് സിസ്റ്റങ്ങൾ സുരക്ഷിതമല്ല.