ചില അലർജിക്കാർ പ്രവചിക്കുന്നതുപോലെ എൽ നിന്യോ പ്രശ്നങ്ങൾക്ക് ഇടയാക്കുമോ എന്നതു സംബന്ധിച്ച് വലിയ തർക്കമുണ്ട്.
എൽ നിനോയെക്കുറിച്ച് തെറ്റായ അതേ അലർജിസ്റ്റുകൾ, എൽ നിനോ കുഴപ്പമുണ്ടാക്കുമെന്ന് പ്രവചിക്കുന്നു.