ആദ്യത്തെ യൂറോപ്യന്മാരുടെ വരവിനു വളരെ മുമ്പുതന്നെ, ചൈനയുമായുള്ള ജപ്പാന്റെ വ്യാപാരത്തിന്റെ പ്രധാന കേന്ദ്രമായിരുന്നു നാഗസാക്കി.
യൂറോപ്യന്മാർ എത്തുന്നതുവരെ ചൈനയുമായുള്ള ജപ്പാന്റെ വ്യാപാരത്തിൽ നാഗസാക്കി അത്ര പ്രധാനമായിരുന്നില്ല.