La réalisation de tests portant sur de multiples SNP chez les femmes porteuses de BRCA2 et BRCA1 peut-elle être utilisée pour améliorer les modèles de prédiction des risques en conjonction avec une évaluation clinique ? A: Oui, B: Non, C: Peut-être
Contexte: Plusieurs polymorphismes nucléotidiques simples (SNP) à différents locus ont été associés à la susceptibilité au cancer du sein, représentant environ 10 % de la composante familiale. Des études récentes ont mis en évidence des associations directes entre des SNP spécifiques et le cancer du sein chez les porteuses de mutations BRCA1/2. Notre objectif était de déterminer si les scores de SNP de susceptibilité validés améliorent la capacité prédictive des modèles de risque en comparaison/conjonction avec d'autres informations cliniques/démographiques. Des femmes porteuses de BRCA1/2 ont été identifiées à partir de la base de données génétiques de Manchester, et incluses dans l'étude quel que soit leur statut de cancer du sein ou leur âge. L'ADN a été extrait d'échantillons de sang fournis par ces femmes et utilisé pour le profilage des gènes et des SNP. Les estimations de survie ont été examinées à l'aide des courbes de Kaplan-Meier. Des modèles de risques proportionnels de Cox multivariables ont été adaptés dans les ensembles de données BRCA séparés et aux stades de la ménopause, en analysant différentes combinaisons de variables cliniques/démographiques/génétiques. Des forêts de survie aléatoires non linéaires ont également été ajustées pour identifier les interactions pertinentes. Les modèles ont été comparés à l'aide de l'indice de concordance de Harrell (1 - indice c). 548 femmes porteuses de la mutation BRCA1 et 523 porteuses de BRCA2 ont été identifiées dans la base de données. L'estimation médiane de Kaplan-Meier de la survie était de 46,0 ans (44,9-48,1) pour les porteuses de BRCA1 et de 48,9 (47,3-50,4) pour BRCA2. En ajustant les modèles de Cox et les forêts de survie aléatoires, incluant à la fois un score SNP génétique et des variables cliniques/démographiques, les valeurs moyennes de 1 - indice c étaient de 0,221 (écart-type 0,019) pour les porteuses de BRCA1 et de 0,215 (écart-type 0,018) pour les porteuses de BRCA2.