Система імунного захисту ротової порожнини вдало поєднує різноманітні неспецифічні і специфічні фактори, що забезпечують ефективний захист від каріесогенних та інших хвороботворних мікробів.
Клітини слизової оболонки виконують функції механічного бар’єру. Особливе значення має антимікробну активність слини. Протягом доби в організмі дорослої людини виробляється до 2 л слини – секрету з вираженою ферментативної активністю. Це не тільки потужний фізико-хімічний, а й біологічний бар’єр. Слина містить широкий набір речовин, що володіють вираженими бактерицидними властивостями: лізоцим, лактоферин, лактопероксидаза, окремі компоненти комплементу та ін. У слині також постійно присутні до 200 тисяч фагоцитуючих клітин. У сполучнотканинної стромі ротової порожнини також виявляються клітинні елементи неспецифічної резистентності: активно мігруючі тканинні макрофаги, фібробласти, гранулоцити і огрядні клітини.
Система специфічного імунного захисту ротової порожнини представлена потужними миндалинами глоткового кільця, добре розвиненою системою лимфоидного дренування в підщелепних, під’язикових, привушних і шийних лімфовузлах. У тканинах виявляються лімфоїдні скупчення, а в слині – лімфоцити і широкий спектр імуноглобулінів. Кількісно домінує IgA. Тут його міститься помітно більше, ніж у сироватці крові. Найбільшу функціональне навантаження несе секреторна форма
IgA (sIgA). Зміст IgM, G і E в слині дещо менше, ніж у сироватці крові. Зниження вмісту в слині імуноглобулінів, особливо IgA, загрожує гнійно-запальними або алергічними захворюваннями слизової оболонки ротової порожнини.