একটি জায়গায় তার সমালোচনা রয়েছে, সেটি হলো, তিনি ১৯৯২ সালে বাবরি মসজিদ ধ্বংস হওয়ার সময়ে তা আটকানোর যথেষ্ঠ প্রচেষ্টা দেখাননি বা ২০০২-এর দাঙ্গার পরে মোদীকে সরাননি দলের হিন্দু ভোটব্যাঙ্ক খোয়ানোর ভয়ে।
তার একটি সমালোচনা হল যে ১৯৯২ সালে বাবরি মসজিদ ধ্বংস হলে তিনি তা বন্ধ করার জন্য যথেষ্ট প্রচেষ্টা করেননি বা ২০০২ সালের দাঙ্গার পরে মোদি আন্দোলনের হিন্দু ভোটব্যাংক হারানোর ভয় ছিল।