وفي جنوب شرق اسيا, يكون للطلاب المسلمين اختيار حضور حكومة علمانية او مدرسة اسلامية. المدارس الاسلامية او المدارس الاسلامية تعرف باسم sekolah agama (الملايو: المدرسة الدينية) في ماليزيا واندونيسية, rongreīyn ṣ̄ās̄nā xis̄lām (التايلندية: مدرسة الاسلام) في تايلند و مدارسن في الفلبين. وفي البلدان التي لا يكون فيها الاسلام هو الاغلبية او دين الدولة, توجد المدارس الاسلامية في مناطق مثل جنوب تايلند (بالقرب من الحدود التايلندية - الماليزية) وجنوب الفلبين في مينداناو, حيث يمكن العثور على عدد كبير من المسلمين.
من يقرر ما اذا كان المسلمون يحضرون المدارس العلمانية او التقليدية التقليدية?
الطلاب