وقد تبرعت المؤسسة بلايين الدولارات لمساعدة المصابين بالايدز والسل والملاريا, وحماية الملايين من الاطفال من الموت على ايدي الامراض التي يمكن الوقاية منها. ومع ذلك, فان تحقيق في عام 2007 من قبل لوس انجلوس تايمز يدعي ان هناك ثلاثة عواقب رئيسية غير مقصودة مع تخصيص المؤسسة للمعونة. اولا, تعاني افريقيا جنوب الصحراء الكبرى بالفعل من نقص في الاطباء الاوائل قبل وصول مؤسسة جيتس, ولكن من خلال صب معظم المساهمات في مكافحة قتلة من ذوي المستوى العالي مثل الايدز, زاد من الطلب على المنح التي تم تدريبها بشكل خاص, اعلى-الاطباء ذوي الاجر, وتحويل الموظفين من الرعاية الاساسية في افريقيا جنوب الصحراء الكبرى. وتضيف هذه هجرة الدماغ الى نقص الاطباء الحالي و يسحب موظفين مدربين اضافية من الاطفال والذين يعانون من قتلة شائعة اخرى. ثانيا, ان التركيز على عدد قليل من الامراض قد ادى الى زيادة الاحتياجات الاساسية مثل التغذية والنقل. ثالثا, ان برامج التطعيم الممولة من البوابات قد اصدرت تعليمات الى مقدمي الرعاية ان يتجاهل - حتى  تثبيط المرضى عن مناقشة - الامراض التي لا يمكن ان تمنعها اللقاحات.
برامج التطعيمات شجع ايه
 تثبيط المرضى عن مناقشة - الامراض التي لا يمكن ان تمنعها اللقاحات.