ويبدا الفصل السادس بالقول ان الفصول الثلاثة التالية ستتناول ما يمكن ان تفعله على النظرية, واولها انه لا توجد في كثير من الاحيان اشكال متوسطة بين الانواع ذات الصلة وثيقة, على الرغم من ان النظرية تعني ان مثل هذه الاشكال يجب ان تكون موجودة. وكما لاحظ داروين, اولا, لماذا, اذا كانت الانواع قد تنحدر من انواع اخرى بواسطة insensibly غرامة التدرج, هل نحن لا نرى في كل مكان اشكال انتقالية لا تحصى? لماذا لا تكون كل الطبيعة في حيرة, بدلا من ان تكون الانواع, كما نراه, محددة جيدا? عزا داروين هذا الى  المنافسة بين اشكال مختلفة, بالاضافة الى عدد قليل من الافراد من الاشكال المتوسطة, والتي غالبا ما تؤدي الى انقراض مثل هذه الاشكال. ويمكن الاشارة الى هذه الصعوبة بانها غياب او ندرة الاصناف الانتقالية في الفضاء.
لماذا يتساءل داروين لماذا كل الطبيعة ليست فوضوي و عشوائي?
 لماذا, اذا كانت الانواع قد تنحدر من انواع اخرى بواسطة insensibly غرامة التدرج, هل نحن لا نرى في كل مكان اشكال انتقالية لا تحصى?