प्राकृतिक धर्मशास्त्र एक एकीकृत सिद्धांत नहीं था, और कुछ जैसे लुई अगसिज़ ने पुस्तक में विचारों का पुरजोर विरोध किया था, दूसरों ने एक सुलह की मांग की जिसमें विकास को उद्देश्यपूर्ण रूप से देखा गया था । इंग्लैंड के चर्च में, कुछ उदार clergymen ने भगवान के डिजाइन के एक साधन के रूप में प्राकृतिक चयन की व्याख्या की, मौलवी चार्ल्स किंग्सले के साथ इसे सिर्फ भगवान की एक अवधारणा के रूप में देखते हुए । जनवरी 1860 के दूसरे संस्करण में, डार्विन ने किंग्सले को एक मनाया गया मौलवी के रूप में उद्धृत किया, और निर्माता द्वारा वाक्य को समापन वाक्य में जोड़ा, जो फिर से जीवन को पढ़ने के लिए, अपनी कई शक्तियों के साथ, मूल रूप से निर्माता द्वारा गूंजते हुए कुछ रूप या एक में । जबकि कुछ कमेंटेटर ने इसे धर्म के लिए एक रियायत के रूप में ले लिया है कि डार्विन ने बाद में खेद व्यक्त किया, समय पर डार्विन का दृश्य भगवान के लिए प्रकृति के नियमों के माध्यम से जीवन बना रहा है, और पहले संस्करण में भी निर्माण के लिए कई संदर्भ हैं ।
डार्विन ने यह दिखाने के लिए क्या किया कि उसने मौलवी चार्ल्स किंग्सले की प्रशंसा की?
 डार्विन ने किंग्सले को एक मनाया गया मौलवी के रूप में उद्धृत किया, और निर्माता द्वारा वाक्य को बंद वाक्य में जोड़ा,