Ein öffentliches Genom-Sequenzierung von Baumwolle wurde im Jahr 2007 von einem Konsortium von öffentlichen Forschern initiiert. Sie haben sich auf eine Strategie geeinigt, um das Genom von kultiviert, tetraploid Baumwolle zu Sequenz. Tetraploid bedeutet, dass kultiviert Baumwolle tatsächlich zwei separate Genome in ihrem Kern hat, die als A und D-Genome bezeichnet werden. Das Sequenzierung-Konsortium hat erstmals vereinbart, das D-Genom-Verhältnis von kultiviert Baumwolle (G. raimondii, eine wilde amerikanische Baumwolle) zu Sequenz, wegen seiner geringen Größe und einer begrenzten Anzahl von repetitive Elementen. Es ist fast ein Drittel die Anzahl der Basen von tetraploid Baumwolle (AD), und jedes Chromosom ist nur einmal vorhanden.[Klärung erforderlich] Das A-Genom von G. Arboreum würde als nächstes sequenziert werden. Das Genom ist ungefähr doppelt so groß wie G. raimondii 's. Ein Teil des Unterschied in der Größe zwischen den beiden Genome ist die Verstärkung von LTR (GORGE). Sobald beide diploiden-Genome montiert sind, könnte die Forschung beginnen, die eigentlichen Genome von kultivierten Baumwolle zu entschlüsseln. Diese Strategie ist aus der Notwendigkeit heraus; wenn man das tetraploid-Genom ohne Modell diploiden Genome Sequenz würde, würden die euchromatic DNA-Sequenzen der AD-Genome Co-montieren und die repetitive Elemente von AD-Genome unabhängig in A-und D-Sequenzen zusammenstellen. Dann würde es keine Möglichkeit geben, die Chaos von AD-Sequenzen zu entwirren, ohne sie mit ihren diploiden Kollegen zu vergleichen.
Wann hat sich eine Gruppe von Forschern entschieden, die genomischen Struktur von tetraploid Baumwolle zu Sequenz?
2007