细菌传统上适用于所有微观, 单细胞原核生物. 然而, 分子系统系统显示原核生活由两个单独的领域组成, 最初称为真菌和archaebacteria, 但现在称为细菌和古细菌, 从一个古老的共同祖先独立进化. 古细菌和真核生物比细菌更紧密地联系在一起. 这两个领域, 连同同, 是三 域 系统的基础, 这是目前在microbiolology最广泛使用的分类系统. 然而, 由于最近的分子系统系统的介绍和可用的基因组序列的迅速增加, 细菌分类仍然是一个不断变化和扩大的领域. 例如, 几个生物学家争辩说, 古细菌和真核生物从克里阳性细菌进化.
什么域系统常被用于分类微生物?
三 域 系统