第十一章处理来自生物地理学的证据, 从观察到不同地区的植物和动物的差异不能仅由环境差异来解释; 南美, 非洲和澳大利亚都有类似纬度的类似气候的地区, 但这些地区非常不同的植物和动物. 在一个大陆的一个地区发现的物种与在同一大陆的其他地区发现的物种相比, 比在其他大陆发现的物种更紧密. 达尔文指出, 移民的障碍在不同地区的物种之间的差异中发挥了重要作用. 尽管巴拿马地峡只有几英里宽, 但中美洲大西洋和太平洋地区的沿海海洋生活几乎没有共同的物种. 他的解释是移徙和血统与修改的结合.他继续说: 在这一继承的原则中, 我们可以理解, 这一部分的属, 整个属, 甚至家庭都局限于同样的领域, 就像如此常见和众所周知的情况. 达尔文解释了一个从一个大陆形成几百英里的火山岛如何可能被来自该大陆的几个物种殖民. 这些物种会随着时间的推移变得改变, 但仍会与大陆上发现的物种有关, 达尔文观察到这是一个常见的模式. 达尔文讨论了物种可以分散到海洋中去殖民岛屿的方式, 其中许多是他在实验中调查的.
达尔文认为这可以解释为什么不同地区在他们亲密的时候会有这样的不同物种?
移民的障碍在不同地区的物种之间的差异中发挥了重要作用.