Umat Katolik Mangalore
Orang-orang Portugis menolak mengakui penunjukan Uskup de Castro dan menentang dengan keras berbagai aktivitasnya. Kematian Uskup Agung Brandão secara mendadak pada 6 Juli 1678 membuat situasi bertambah rumit, dan kapitel katedral ("cathedral chapter") yang mengelola Keuskupan Agung Goa setelah kekosongan takhta akibat kematiannya, melarang umat Katolik Kanara menerima sakramen-sakramen dari sang uskup atau dari para imam yang ditunjuk olehnya. Sebaliknya, Uskup de Castro mengekskomunikasi umat Katolik yang tunduk pada otoritas sang Padroado di Goa dan para imam mereka. Pada tahun 1681, Takhta Suci menunjuk imam Goa lainnya, Pastor Joseph Vaz, sebagai "Vicar Forane" Kanara; ia diminta untuk tidak tunduk pada Uskup de Castro kecuali ia diperlihatkan surat penunjukannya. Namun setelah diyakinkan akan keabsahannya, Pastor Vaz tunduk kepada Uskup de Castro dan menghasilkan suatu perdamaian. Ia kemudian berhasil membujuk Uskup de Castro untuk mendelegasikan kewenangan kepadanya sementara sang uskup tetap pada posisinya. Pada tahun 1700, umat Katolik di Kanara kembali berada di bawah yurisdiksi Uskup Agung Padroado di Goa.