Але мікроорганізми: бактерії, грибки та актиноміцети працюють над розпадом органічних решток до речовин, якими можуть харчуватися інші організми. Багатоніжки та дощові хробаки пережовують ці рештки. Всі живі організми, які риють ґрунт, аерують його, випорожнюються та виділяють нітрати у ґрунт, лишають там свої рештки, роблять отвори, копають та роблять канали для проходження води.