Die Methode der Empfängnisverhütung kann die Zusammensetzung der Scheidenflora beeinflussen, das hat Auswirkungen auf die Wahrscheinlichkeit eine bakterielle Vaginose zu bekommen. Für die Gesunderhaltung der Scheidenflora kann mithilfe gynäkologischer Behandlung gesorgt werden, wobei eventuell die Wahl einer anderen Verhütungsmethode Besserung bringen kann.