Schah Ruch stand einer neuen Situation gegenüber: sein Reich musste organisiert werden, um ein weiteres Auseinanderbrechen zu verhindern. Er richtete sich in Herat ein und kümmerte sich hauptsächlich um Persien. Dort musste er sich mit seinen eigenen Verwandten und mit Timurs alten Gegnern, den Qara Qoyunlu auseinandersetzen. Gegen die unzuverlässigen Timuridenprinzen ging Schah Ruch vor, indem er sie wiederholt von einem Statthalterposten auf einen anderen versetzte. Trotzdem kam es beispielsweise in Fars und in Kirman zu Rebellionen, gegen die dann seine Truppen einschreiten mussten – Schah Ruch starb 1447 sogar auf einem Feldzug gegen einen seiner unbotmäßigen Enkel. Auch die Qara Qoyunlu, die 1408 Miran Schah bei Täbris besiegt und zwei Jahre später Bagdad von den Dschalairiden erobert hatten, blieben trotz aller Erfolge (und der Anerkennung seiner Oberherrschaft) ein ungelöstes Problem seiner Regierung.