Im 19. Jahrhundert zogen auch wieder Katholiken in die Stadt. 1894 gründeten sie erneut eine eigene Kirchengemeinde und erbauten die Kirche St. Elisabeth, zu der auch die Katholiken benachbarter Städte und Gemeinden gehörten. Bereits 1903 wurde in der Nicolaistraße 4 in Gera die dortige Fabrikhalle zur Kirche umgebaut und geweiht. Die Kirche erhielt als Schutzpatronin die Heilige Elisabeth von Thüringen. 100 Jahre nach der Einweihung der „St. Elisabeth“-Kirche war die Bausubstanz der einstigen Fabrikhalle nicht mehr sanierfähig. So entschloss die Gemeinde, ein nahegelegenes Grundstück mit einem sanierungsfähigen Gründerzeit-Gemeindehaus und dem Bauplatz für einen Kirchenneubau zu erwerben. Das Gemeindehaus wurde nach komplexen Umbauten im November 2000 eingeweiht, die neu erbaute Kirche konnte im November 2003 geweiht werden. Seit 2018 gehören zur Pfarrei St. Elisabeth neben der Hauptkirche auch die 1985 geweihte Hl.-Maximilian-Kolbe-Kirche in Lusan sowie die Kirchen Mariä Verkündigung (Eisenberg), St. Josef (Hermsdorf), St. Nikolaus (Kahla), Maria Geburt (Ronneburg) und St. Jakobus (Stadtroda). Die St.-Jakobus-Kirche in Langenberg von 1989 wurde 2021 profaniert. Die Stadt ist heute Sitz eines Dekanats innerhalb des Bistums Dresden-Meißen.