Die Symptome des Hikikomori beginnen schleichend und führen bei Vollausprägung zum vollständigen Rückzug der Person aus der Gesellschaft. Dabei sind die wichtigsten Schritte Verlust der Lebensfreude, Verlust von Freunden, zunehmende Unsicherheit, Scheu und abnehmende Kommunikationsbereitschaft. In einer Fallstudie wurden die Symptome angegeben: fehlendes Vertrauen in Menschen (alle 35 untersuchten Fälle), dissoziative Identität (71 %), soziale Phobie (71 %), Schlafstörungen (66 %), emotionale Taubheit (66 %), somatische Beschwerden (54 %), Depression (46 %) und suizidale Gedanken (43 %).