In den folgenden Jahren veröffentlichte Rare Spiele, die schon für Nintendos Gamecube in Entwicklung gewesen sind. Weder Grabbed by the Ghoulies, Kameo Elements of Power noch Perfect Dark Zero konnten, insbesondere in puncto Verkaufszahlen, an alte Erfolge anknüpfen. Im Jahr 2006 erschien Viva Piñata und wenig später im Jahr 2007 verließen die Gründer Tim und Chris Stamper die Firma. Die langjährigen Rare-Mitarbeiter Gregg Mayles und Mark Betteridge übernahmen die Führung, doch auch die im Jahre 2008 erschienenen Spiele Viva Pinata Trouble in Paradise und Banjo Kazooie Schraube Locker wurden keine Erfolge.