Der Befehl wurde nicht wieder in Kraft gesetzt. Die Morde an jüdischen Kriegsgefangenen im Operationsgebiet gingen aber unverändert weiter. Noch im Juli 1943 erklärte das OKH, dass jüdische Kriegsgefangene nicht nach Westen abgeschoben werden sollen, sondern an die Sicherheitspolizei zu übergeben wären, die diese dann ausnahmslos ermordete. Nicht alle Morde fanden im Operationsgebiet statt. Ein erheblicher Teil wurde in die Lager in den Reichskommissariaten oder im Generalgouvernement abgeschoben und dort ermordet. Auch das Überleben der Politkommissare, die in Aufnahmelagern östlich der Reichsgrenze selektiert wurden, war nicht gesichert. Im KZ Neuengamme wurden im Herbst 1942 etwa 200 sowjetische Politkommissare durch Zyklon B ermordet; Mitte April 1943 wurden noch 59 Politkommissare zur Liquidierung ins KZ Mauthausen geschickt.