Die häufigste Ursache ist die persistierende Mund-Antrum-Verbindung (MAV), beispielsweise nach einer Zahnentfernung, gefolgt von der apikalen Parodontitis in Folge einer entzündlichen Pulpaerkrankung. Weitere Ursachen können Wurzelreste, Parodontitis, eine periimplantäre Entzündung, odontogene Zysten, in die Kieferhöhle dislozierte Zähne oder Implantate sein sowie Augmentationsmaterial nach einem präprothetischen Sinuslift.