Der Bahnhof Mering hat heute vier Bahnsteiggleise an zwei Mittelbahnsteigen. Er wird auf der Bahnstrecke München–Augsburg im Halbstundentakt durch den Fugger-Express der Go-Ahead Bayern bedient. Unter diesem Namen verkehren im Stundentakt Regional-Express-Züge von München nach Ulm (RE9), Regionalbahnen von München nach Dinkelscherben (RB86) und Donauwörth (RB87), sowie im Zweistundentakt Züge von München nach Würzburg (RE80) und Aalen (RE89). Die Züge werden jeweils im Augsburger Hauptbahnhof geflügelt. In der Hauptverkehrszeit fahren zusätzliche Verstärkerzüge zwischen München und Augsburg bzw. ab Mering nach Augsburg. Auf der Ammerseebahn (RB67) verkehrt die Bayerische Regiobahn (BRB) im Stundentakt zwischen Augsburg-Oberhausen und Schongau. In der Hauptverkehrszeit setzt die BRB stündliche Verstärkerzüge zwischen Augsburg und Mering ein, die teilweise weiter nach Geltendorf fahren. Dadurch entsteht zwischen Augsburg und Mering ganztags ein rechnerischer 20-Minuten-Takt und in der Hauptverkehrszeit teilweise ein rechnerischer 10-Minuten-Takt. Fernverkehrszüge halten nicht in Mering.