Am 3. Juli 2013 begann eine erneute stärkere Aktivität. 47 Flüge mussten gestrichen werden. Delta Air Lines, United Airlines, Alaska Airlines sowie AirTran Airways annullierten in der Folge sämtliche Verbindungen nach Mexiko-Stadt. Asche ging auf zahlreiche Orte der Umgebung nieder, so auch auf Mexiko-Stadt und Puebla. Die Ortschaft San Pedro Nexapa wurde mit 5 Zentimetern Asche eingedeckt – soviel hatte es in den 15 Jahren zuvor nie gegeben. Am 6. Juli 2013 wurde die Alarmstufe erneut auf „Phase 3 Gelb“ angehoben und bis zum 23. Juli beibehalten. Ascheausstöße verursachten eine komplette Sperre des Flughafens Puebla am 12. Juli 2013. Danach beruhigte sich die Situation am Vulkan wieder, die Alarmstufe verblieb auf „Phase 2 Gelb“.