Gegen Ende 2005 kam es zu einem Rechtsstreit zwischen JoWooD und dem australischen Unternehmen Perception, das ursprünglich den Titel Stargate SG-1 für JoWooD entwickeln sollte. Perception stellte einen erfolglosen Konkursantrag gegen JoWooD wegen ausgebliebener Zahlungen, während JoWooD eine Betrugsanzeige gegen Perception einbrachte, da laut JoWooD bei der Produktion weder die gewünschte Qualität geliefert noch der vereinbarte Zeitrahmen eingehalten wurde. Das Spiel wurde Anfang 2006 endgültig eingestellt und allen Mitarbeitern gekündigt. JoWooD selbst stand nach dem Rechtsstreit erneut kurz vor der Insolvenz. Am 17. November 2005 gab JoWooD den Einstieg von Koch Media GmbH als strategischen Investor bekannt. Im Rahmen eines Debt Equity Swaps verzichtete Koch Media auf Forderungen gegenüber JoWooD. Im Januar 2006 stand eine weitere Barkapitalerhöhung ins Haus.