Die Lebensräume des Alpensalamanders liegen unter anderem in Karstgebieten und Hochgebirgsschluchten. Er kommt in den Alpen meist ab Höhen von , regional auch schon ab  NN vor; nur selten findet man Exemplare in tieferen Lagen (Einzelangaben aus der Literatur:  bei Walensee/Schweiz,  in Österreich). Manchmal können solche Funde auch auf die Verdriftung von Tieren mit reißenden Bächen zurückzuführen sein. Die höchsten Einzelfundorte liegen bei  in Kärnten/Österreich und  in der Schweiz; in den deutschen Alpen steigt die Art selten über , ausnahmsweise bis auf . Überwiegend werden feuchte Laub- und Bergmischwälder in der Nähe von Gebirgsbächen besiedelt, oberhalb der Baumgrenze Biotope wie feuchte Alpenweiden, Zwergstrauchheiden und Schutthalden. Hier ist der Alpensalamander unter Steinen oder Totholz anzutreffen.